St. Bonaventure University

School of 艺术 & 科学 教师


Zhang, Xiao-Ning

Xiao-Ning Zhang

ACADEMIC DEPARTMENT
生物学
ACADEMIC SCHOOL
School of 艺术 and 科学

TITLES/RESPONSIBILITIES
联系
办公室
Walsh Science Center 216
COURSES TAUGHT
  • 生物105. Biological Science I 
  • 生物106. Biological Science II 
  • BIO 135 Introduction to Bio Technology
  • BIOL 135 Introduction to Bio Technology Lab
  • 生物371. 生物化学 
  • 杂志371年. 生物化学 Lab  
  • 生物399. 生物学 Seminar 
  • 生物406. Plant Development and Physiology  
  • 杂志406年. Plant Development and Physiology Lab  
  • BIO 460 生物化学 Seminar
  • 生物466. Molecular Cell 生物学
  • 杂志466年. Molecular Cell 生物学 Lab
  • 单位101. Community of learners
ACADEMIC DEGREES
  • Ph.D., Fudan University, China
  • M.S. & B.S., Nanjing University, China
OTHER EDUCATION
  • M.A. in Applied Healing 艺术, Tai Sophia Institute
  • Postdoctoral Research Associate, Department of Cell 生物学 and Molecular Genetics, University of Maryland, 学院公园, 2006-2009.
  • 2002-2006年,美国宾夕法尼亚大学生物系博士后研究员.
PROFESSIONAL BACKGROUND
ACCOMPLISHMENTS

Grants and Awards

  • National Science Foundation
    • 选择性剪接在植物先天免疫调节中的作用. (2019-2023)
    • 协作:ABI开发:模式创建的方法论, Imprint Validation, and Discovery from the Annotated Biological Web. (2012-2017)
    • RUI: Cloning and characterization of OPENED IMMATURE FLOWER. (2010-2015)
  • St Bonaventure University
      Keenan Award: Aligning 生物学 Lab Planning, 教学设计和共同核心大学准备写作标准促进学生学习. (2012-2013). Co-awardee: Paula Kenneson, School of Education.
    • Community-based Learning Fellowship Award (2009-2010). 共同获奖者:教育学院的Miguel Narvaez和Willy Rotich.

Peer-Reviewed Publications (选择 Publications. * indicates corresponding author)

  1. Samuel L. Chen S, Timothy J. Rooney T, Anna R. 胡,亨特S. Beard, Wesley M. Garrett, Leann M. Mangalath, Jordan J. Powers, 布雷特·库珀, Xiao-Ning Zhang*. 定量蛋白质组学揭示了SERINE/ARGININE-RICH 45在调节RNA代谢和通过ASAP复合物调节转录抑制中的作用 拟南芥 thaliana. Frontiers in Plant Science. 2019年8月. DOI: 10.3389 /国家贫困线以下.2019.01116.
  2. Nannan Zhang, Dandan Zhang, Samuel L. Chen, Ben-Qiang Gong, Yanjun Guo, Lahong Xu, Xiano-Ning Zhang and Jian-Feng Li*. 用于多基因沉默和简化转基因筛选的工程人工microrna. Plant Physiology. 2018年11月. 178(3): 989-1001. DOI: 10.1104/pp.18.00828.
  3. Xiao-Ning Zhang*, Yifei史, Jordan Powers, Nikhil高达, Chong张, Heba易卜拉欣, 汉娜球, 塞缪尔·陈, 华陆, Stephen Mount. 转录组分析表明,SR45是拟南芥中一个中性剪接调节因子和先天免疫抑制因子. BMC基因组学. 18:722. October 11, 2017. DOI: 10.1186/s12864-017-4183-7.
  4. 凯文·西拉诺,扎卡里·马扎内克,马哈茂达·汗,莎拉·梅特卡夫, Xiao-Ning Zhang*. A new mutation, hap1-2, 揭示了AtMago蛋白C末端结构域的功能及其在雄性配子体发育中的生物学作用 拟南芥 thaliana. PlosOne. 11(2):e0148200. February 11, 2016. DOI: 10.1371 /杂志.玉米饼.0148200.
  5. Xiao-Ning Zhang*, Cecilia Mo, Wesley M. Garrett, 布雷特·库珀. 磷酸苏氨酸218是SR45发挥功能所必需的.1 in regulating flower petal development in 拟南芥. Plant Signaling & 行为. 2014. 9:e29134. DOI: 10.4161 /公安局.29134.
  6. Xiao-Ning Zhang & Stephen Mount*. Two alternatively spliced isoforms of the 拟南芥 thaliana SR45蛋白在植物正常发育过程中具有独特的作用. Plant Physiol. 2009, 150(3): 1-9. DOI: 10.1104/pp.109.138180.

Meeting Presentations (Recent Talks)

  1. Xiao-Ning Zhang. Teaching DNA in our life from K through 12. WNY STEAM Conference. 纽约布法罗. August 6, 2018. (选择)
  2. Xiao-Ning Zhang and Jacqueline Philp. 在大学里向非理工科学生教授生物技术和转基因生物. STEM Institute. Alfred State College, NY. 7月y 29-31, 2018. (选择)
  3. Rene Hauser, Jacqueline Philp and Xiao-Ning Zhang. No time lost: Integrated lessons. STEM Institute. Alfred State College, NY. 7月y 29-31, 2018. (选择)
  4. Xiao-Ning Zhang, Chong张, Jordan Powers, 华陆. 剪接激活子SR45是植物免疫的全局抑制因子. Post-transcriptional Gene Regulation in Plants Meeting. 得克萨斯州奥斯汀市. 7月y 14-15, 2016. (选择
  5. Xiao-Ning Zhang. High quality RNAs for healthy pollen. 17th Plant 生物学 Minisymposium, May 26, 2016. (邀请)
  6. Xiao-Ning Zhang. 磷酸化调控通过剪接激活剂诱导前mrna剪接, SR45, during flower development. Plant and Animal Genome XXIII Conference. 圣地亚哥,加州. January 10-14th, 2015. (邀请)
Student Research Posters (Highlights)
  1. Xiao-Ning Zhang艾米丽·M. Ranseen, Hunter S. Beard, Wesley M. Garrett, Jordan J. Powers, Chong张, Arthur G. Hunt, 布雷特·库珀 & 华陆. 转录组和蛋白质组的比较分析揭示了丝氨酸/精氨酸富45在拟南芥先天免疫应答中的作用. FASEB研究会议-植物发育机制. 纽约Olean. 7月y 28-August 2, 2019.
  2. 塞缪尔·陈, Timothy Rooney, Yifei史, 史蒂夫·山, 猎人的胡子, Wesley Garrett, 布雷特·库珀, Xiao-Ning Zhang. 转录组和蛋白质组在拟南芥繁殖过程中对前mrna剪接干扰的响应. 戈登研究会议:植物分子生物学. Holderness, NH. June 10-15, 2018.
  3. Jordan Powers, Chong张, 华陆, Xiao-Ning Zhang. A splicing regulator, serine/Arginine-rich 45, 在拟南芥的先天免疫抑制中发挥了新的作用. Plant 生物学 Meeting 2017. Honolulu, Hawaii. 7月. 24-28, 2017. (Powers received ASPB travel award.)
  4. Jordan Powers, Nikhil高达, Xiao-Ning Zhang. RNA-seq数据分析揭示了SR45在植物先天免疫中的新作用. Rustbelt RNA Meeting. 克利夫兰,哦. October 14-15, 2016. (Powers’s selected talk. 曾获优秀大学生口头报告奖.)
  5. Vanya Aggarwal, Rijo Maracheril, Xiao-Ning Zhang. AtKIN11和AtKIN10突变及其对蛋白质结构和葡萄糖传感的影响. Plant 生物学 Meeting. Minneapolis, MN. 7月y 25-29, 2015.
TEACHING PHILOSOPHY
  1. 为主动学习创造互动的教学环境.
  2. 帮助学生将课本知识与现实问题联系起来.
  3. 把真正的研究项目带到教室和实验室.
  4. 向学生介绍科学界,让他们探索.
CURRENT RESEARCH INTERESTS/PROJECTS

生物不断地将来自周围环境的信息/信号纳入其生存策略,以最大限度地提高繁殖成功率. 我的长期兴趣是了解植物如何整合环境信号, including biotic and abiotic stresses, into the regulation of growth and development. 迈向这种理解的第一步是回答这个问题:植物如何通过调节前mrna剪接来响应环境信号来调节生长和发育?

前mrna剪接是所有真核细胞的必要调控步骤. Using next generation sequencing (NGS), 科学家们已经发现了越来越多的剪接事件,即使是在研究得很好的物种中,以前也没有记录过. 到目前为止, my lab has found evidence that a splicing activator, SR45, 参与植物生长发育,并对冷/热胁迫和糖供应作出反应(Plant Physiol. 150:1450-1458. 2009). 我们的工作表明,SR45蛋白上的单个磷酸化事件以组织特异性的方式直接影响SR45的功能(Plant Signaling & 行为. 9:e29134. 2014). 此外,我们还发现了SR45与7个蛋白之间的新关联,包括 U5 snRNP组分和SR蛋白采用共免疫沉淀(Plant Signaling & 行为. 9:e29134. 2014). In collaboration with a computer scientist, Dr. Padmini Srinivasan, 来自爱荷华大学和马里兰大学的生物学家, 我们为生物学家开发并实地测试了一个文献扫描系统:FERRET (BMC BIOINFORMATICS). 16:198. 2015). 这篇论文在出版的第一个月就被全球网赌十大网站了4000多次.

我计划将上述工作扩展到以下三个目标:

  1. 确定SR45参与的分子网络.
  2. 了解物种间剪接网络的进化意义.
  3. 探讨RNA质量控制导致雄性配子体发育成功的机制.

With the rapid development in NGS and proteomics, 我们试图回答sr45调控的剪接事件中有多少在蛋白质水平上具有生物学重要性的问题. With bioinformatics analysis, 我们最近发现SR45可能通过控制一部分防御基因来抑制植物先天免疫. This opens up an exciting, pre-RNA剪接机制调控植物免疫的研究尚待探索. 这将有助于阐明SR45在剪接中的新作用, gene silencing, 非生物应激反应和其他尚未揭示.

An interview by DNASTAR是一家全球性的生物信息学软件公司,它抓住了我的研究兴趣和目前的活动.

对分子生物学培训机会感兴趣的本科生, 遗传学, 生物化学和/或生物信息学欢迎联系我潜在的研究经验.

PERSONAL INTERESTS/COMMUNITY INVOLVEMENT
链接
Dr. Zhang's external website: http://sites.google.com/site/zhanglabwebpage